En 2025, le choix d’un logiciel de comptabilité adapté à son entreprise reste un défi majeur pour les entrepreneurs français. Avec l’évolution constante des normes comptables et des technologies, il devient essentiel de comparer soigneusement les solutions disponibles sur le marché. Cette analyse approfondie vous guidera dans la sélection du logiciel qui répondra parfaitement à vos besoins spécifiques, que vous soyez auto-entrepreneur, dirigeant de PME ou responsable d’association.
Les critères pour choisir votre logiciel de comptabilité
La sélection d’un outil de gestion comptable ne s’improvise pas. Pour faire le bon choix en 2025, plusieurs facteurs doivent être pris en compte afin de garantir une solution en adéquation avec votre structure et vos objectifs. Les entreprises qui investissent du temps dans cette phase de sélection optimisent généralement leur efficacité administrative sur le long terme et évitent des changements coûteux de solutions.
Fonctionnalités indispensables à vérifier
Un logiciel de comptabilité performant doit aujourd’hui offrir bien plus que la simple saisie d’écritures. L’import et l’export de données constituent désormais un prérequis, tout comme la gestion complète des journaux comptables. Le rapprochement bancaire automatisé s’avère également crucial pour gagner du temps et réduire les erreurs. Les solutions proposées par memsoft et ses concurrents intègrent généralement des modules de facturation et de suivi des dépenses qui simplifient considérablement le quotidien des entrepreneurs.
La conformité aux normes comptables françaises représente un critère non négociable, particulièrement avec les évolutions légales de ces dernières années. Vérifiez que le logiciel respecte la loi anti-fraude TVA et les exigences du RGPD. L’automatisation des tâches répétitives constitue également un atout majeur, tout comme la possibilité de collaborer efficacement avec votre expert-comptable via un accès partagé sécurisé.
Rapport qualité-prix et modèles d’abonnement
En 2025, les modèles économiques des logiciels comptables se sont diversifiés, allant des solutions open source gratuites aux abonnements SaaS sophistiqués. Les tarifs varient considérablement, de 0€ pour certaines versions de base jusqu’à plus de 30€ mensuels pour des offres complètes. L’investissement doit être proportionnel à vos besoins réels et à la taille de votre structure.
Les solutions SaaS tout-en-un, qui combinent comptabilité, facturation et suivi de trésorerie, offrent généralement un excellent rapport qualité-prix pour les TPE et PME. Ces abonnements démarrent typiquement autour de 20-30€ mensuels. Si vous êtes auto-entrepreneur, des solutions comme Indy proposent des tarifications adaptées à partir de 20€ par mois. Pour les PME plus structurées, des logiciels comme EBP Comptabilité ou Sage offrent des formules modulaires à partir de 22€ et 29€ mensuels respectivement.

Memsoft et ses concurrents sur le marché français
Le paysage des logiciels de comptabilité en France a considérablement évolué ces dernières années. En 2025, plusieurs acteurs se disputent la première place, chacun avec ses spécificités et ses avantages concurrentiels. Une analyse comparative s’impose pour identifier la solution la plus adaptée à votre contexte professionnel.
Les points forts qui distinguent Memsoft
Memsoft se démarque sur le marché français grâce à sa suite logicielle Oxygène, spécialement conçue pour les TPE et PME. Cette solution modulaire et évolutive s’adapte précisément aux besoins spécifiques de chaque entreprise. La conformité aux normes comptables françaises constitue l’un des atouts majeurs d’Oxygène, garantissant une sécurité juridique appréciable pour les utilisateurs.
La force de Memsoft réside également dans la polyvalence de son offre qui couvre non seulement la comptabilité, mais aussi la gestion commerciale, le CRM, la paie et les immobilisations. La dernière version d’Oxygène (11.04.36) intègre les réformes Paie de mai 2025 et la normalisation des factures Service à la Personne, démontrant une réactivité exemplaire face aux évolutions réglementaires. La satisfaction client exceptionnelle, avec une note de 4.54/5 basée sur 73 avis, témoigne de la qualité du service et de la pertinence des solutions proposées.
Analyse comparative des alternatives à Memsoft
Face à Memsoft, plusieurs concurrents proposent des solutions aux caractéristiques variées. Sage, référence historique du secteur, offre une solution complète et modulaire à partir de 29€ mensuels, particulièrement adaptée aux PME structurées et aux cabinets comptables. Sa principale force réside dans sa capacité à répondre à des besoins spécifiques, mais son niveau d’automatisation reste moyen comparé à certaines solutions plus récentes.
EBP Comptabilité se distingue comme un logiciel français fiable et hautement personnalisable, disponible à partir de 22€ par mois. Cette solution convient parfaitement aux PME, TPE et artisans disposant d’un service comptable interne ou externe. Pour les indépendants et professions libérales, Indy propose une interface minimaliste avec une forte automatisation à partir de 20€ mensuels, bien que la collaboration directe avec l’expert-comptable soit moins développée que chez les concurrents.
D’autres acteurs comme Pennylane, Abby ou Cegid Loop complètent ce panorama avec des propositions de valeur distinctes. Les solutions gratuites ou open source comme Dolibarr ou Grisbi peuvent convenir aux structures aux besoins limités ou disposant de compétences techniques internes. Toutefois, ces options présentent généralement des limitations en termes de fonctionnalités avancées ou d’interface utilisateur, nécessitant parfois un paramétrage initial complexe.
| Logiciel | Tarif | Note | Public cible | Points forts |
|---|---|---|---|---|
|
Memsoft Oxygène |
Gratuit (Version complète limitée) |
4,60/5 (68 avis) |
TPE, PME |
• Suite modulaire complète • Version gratuite généreuse • Conformité normes françaises • Support technique réactif |
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Tiime |
Gratuit à 22,99€/mois |
4,8/5 (+4700 avis) |
Auto-entrepreneurs, TPE, PME |
• Automatisation poussée (IA) • Compte pro inclus • +150 000 utilisateurs • Sync 200+ banques |
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Pennylane |
Sur devis | N/A | TPE, PME, ETI |
• Licorne French Tech • Collaboration expert-comptable • PDP facturation électronique • Vision 360° trésorerie |
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Regate (by Qonto) |
Sur devis |
4,8/5 (Trustpilot & G2) |
Cabinets comptables + clients |
• Marque blanche • OCR performant (100%) • Compatible logiciels majeurs • +6 000 cabinets |
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Indy |
Gratuit à 12€/mois |
4,8/5 (+9000 avis) |
Indépendants, micro-entreprises |
• +200 000 utilisateurs • Automatisation IA • Support <4 min • Rapport qualité-prix imbattable |
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Axonaut |
À partir de 55,99€/mois | N/A | TPE, PME (-25 employés) |
• Tout-en-un complet • Module RH (paie) • CRM intégré • +14 000 intégrations |
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FreshBooks |
À partir de 10,80€/mois |
4,5/5 (4492 avis) |
PME, freelances, solopreneurs |
• Solution internationale • Facturation avancée • Payé 2x plus vite • +100 intégrations |
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Sage |
9€ à 25€/mois (Cloud) |
N/A | TPE, PME, ETI, experts-comptables |
• +40 ans d’expérience • Sage AI intégré • Gamme complète • Support 24/7 |
Top 8 Meilleurs logiciels de comptabilité 2025
- Memsoft Oxygène
- Tiime
- Pennylane
- Regate
- Indy
- Axonaut
- FreshBooks
- Sage
Memsoft Oxygène
Memsoft Oxygène s’impose comme une référence pour les TPE et PME françaises grâce à son approche modulaire et évolutive. Créée en 1998, la société éditrice affiche une croissance constante avec un chiffre d’affaires de 1,34 M€ en 2025 et une marge nette remarquable de 22,7%. La suite logicielle Oxygène couvre l’intégralité des besoins de gestion : comptabilité, gestion commerciale, CRM, paie et immobilisations. Son atout majeur réside dans sa version gratuite complète, particulièrement généreuse (comptabilité, gestion commerciale, CRM et paie pour moins de 10 bulletins/mois), permettant aux petites structures de démarrer sans investissement. La solution se distingue également par sa conformité rigoureuse aux normes françaises (BOI DGFIP, FEC, DSN) et ses mises à jour régulières intégrant les dernières réformes légales. Avec une note de 4,60/5 basée sur 68 avis récents, les utilisateurs saluent particulièrement l’excellent rapport qualité-prix, la réactivité du support technique et la simplicité d’utilisation. La plateforme propose en outre des services de télédéclaration (liasses fiscales, TVA, DSN) et un service d’e-facture intégré, préparant les entreprises à la réforme de 2026.
Tiime
Tiime s’est rapidement imposé comme le logiciel « n°1 des entrepreneurs » en France grâce à son approche tout-en-un qui centralise facturation, comptabilité et compte professionnel. Cette solution 100% française, basée à Paris et en Lorraine, compte plus de 150 000 utilisateurs et affiche une note impressionnante de 4,8/5 sur plus de 4 700 avis. L’atout principal de Tiime réside dans son automatisation poussée : synchronisation bancaire avec plus de 200 établissements, rapprochement bancaire automatique, dématérialisation des justificatifs par simple photo avec valeur probante, et utilisation de l’IA pour le matching automatique des pièces. Le logiciel propose une offre gratuite pour la création et l’envoi de factures, puis deux formules payantes à partir de 17,99€ HT/mois (Start) et 22,99€ HT/mois (Business incluant le compte pro avec IBAN français et carte Mastercard). Particulièrement adapté aux auto-entrepreneurs, TPE, PME et professions libérales, Tiime se démarque également par sa conformité à la facturation électronique obligatoire dès 2026 et sa collaboration native avec les experts-comptables. L’interface intuitive accessible sur web et mobile, combinée à un service client français réactif, fait de Tiime une solution particulièrement attractive pour les entrepreneurs souhaitant simplifier leur gestion administrative.
Pennylane
Pennylane incarne la nouvelle génération des logiciels de comptabilité français, ayant atteint le statut de licorne en février 2024 et rejoint le French Tech 120. Fondée en 2019, cette solution SaaS tout-en-un a conquis plus de 500 000 dirigeants, indépendants et directeurs financiers grâce à son approche centralisée qui réunit finances, comptabilité, facturation et compte professionnel sur une seule plateforme. Son positionnement distinctif repose sur la collaboration native entre l’entreprise et l’expert-comptable, travaillant simultanément sur la même interface pour un gain de temps considérable. Pennylane se positionne comme pionnier de la facturation électronique en France, ayant été immatriculé comme PDP (Plateforme de Dématérialisation Partenaire) et levé 75 millions d’euros en avril 2025 spécifiquement pour cette réforme. La solution excelle dans l’automatisation des tâches répétitives (rapprochements, saisie, récupération de justificatifs) et propose une vision 360° de la trésorerie en temps réel, avec gestion du prévisionnel et intégration bancaire complète. Le module de gestion des dépenses (Spend Management) inclut des workflows de validation avancés, tandis que le compte professionnel fourni en partenariat avec Swan offre cartes physiques et virtuelles avec réconciliation automatique. Certifié ISO 27001 pour la sécurité des données, Pennylane s’adresse particulièrement aux TPE, PME et ETI recherchant une solution évolutive et moderne.
Regate (by Qonto)
Regate by Qonto se distingue comme un écosystème collaboratif unique qui rapproche les cabinets d’expertise comptable et leurs clients entreprises. Cette solution en marque blanche, utilisée par plus de 6 000 cabinets et 600 000 entreprises, révolutionne la pré-comptabilité grâce à une automatisation poussée : récupération et dématérialisation des justificatifs avec un OCR propriétaire performant affichant un indice de codage proche de 100%, puis déversement automatique des écritures dans le logiciel comptable de production. L’atout majeur de Regate réside dans sa compatibilité étendue avec les logiciels comptables leaders du marché français (Sage Génération Experts, Cegid Quadra, My Unisoft, Cegid Loop, ACD, Agiris), agissant en surcouche sans nécessiter de migration. La solution intègre également Qonto PDP, une Plateforme de Dématérialisation Partenaire pré-immatriculée pour la facture électronique obligatoire, ainsi qu’un outil gratuit de création d’entreprise en marque blanche permettant la génération de statuts et le dépôt de capital en 20 minutes. Avec des notes de 4,8/5 sur Trustpilot et G2, Regate est particulièrement apprécié pour sa capacité à optimiser la productivité des cabinets comptables en centralisant justificatifs, flux bancaires et notes de frais. Les experts-comptables peuvent ainsi proposer à leurs clients Qonto Facturation pour une collaboration encore plus fluide, tout en bénéficiant d’un support client disponible 5j/7.
Indy
Indy s’est imposé comme la référence des travailleurs indépendants français avec plus de 200 000 utilisateurs conquis par son approche automatisée et accessible. Cette société française basée à Lyon, fondée en 2016, propose une solution complète adaptée aux micro-entreprises, entreprises individuelles (BIC/BNC), SAS, SASU, EURL, SARL et SCI. L’automatisation constitue le cœur de l’offre Indy : synchronisation automatique des transactions bancaires, détection de la TVA, classement automatique des écritures grâce à l’IA, et télétransmission de certaines déclarations (TVA, 2035 pour les BNC). La solution intègre un module de facturation complet, un compte professionnel avec carte Mastercard et virements illimités, ainsi qu’un accompagnement gratuit pour la création d’entreprise. Avec des notes exceptionnelles (4,8/5 sur Trustpilot basé sur plus de 9 000 avis, 4,9/5 sur l’App Store), Indy se distingue par son rapport qualité-prix imbattable : une offre Essentiel gratuite incluant les outils de base, puis des formules Plus à 9€/mois HT et Premium à 12€/mois HT (incluant l’automatisation des déclarations fiscales). Une promotion actuelle offre -50% sur le lancement de la comptabilité LMNP. Le support client réactif (réponse en moins de 4 minutes) et les alertes intelligentes sur les échéances importantes complètent une offre particulièrement attractive pour les indépendants, même si la solution reste un logiciel ne remplaçant pas les conseils stratégiques d’un expert-comptable dédié.
Axonaut
Axonaut se positionne comme l’allié tout-en-un des TPE et PME de moins de 25 employés, particulièrement celles opérant en équipe dans les services, le digital ou le commerce. Cette solution SaaS française, labellisée French Tech et utilisée par plus de 189 000 entrepreneurs, se distingue par une approche « tout compris » rare sur le marché : un seul niveau tarifaire débloque l’intégralité des modules (comptabilité, facturation, CRM, gestion de projet, RH et trésorerie), contrairement aux concurrents proposant des options fragmentées. Le module de pré-comptabilité automatise les tâches répétitives avec rapprochement bancaire et exports comptables personnalisés, tandis que l’accès gratuit pour l’expert-comptable facilite la collaboration. La force d’Axonaut réside dans ses fonctionnalités RH rarement disponibles sur ce type de plateforme (édition de bulletins de paie au format légal, gestion des congés et notes de frais). Le module CRM différenciant permet un suivi commercial complet avec emailing/SMS et segmentation clients. La facturation avancée intègre signature électronique, notifications d’ouverture, paiement en ligne et relances automatiques (60% des factures en retard réglées après relance). Avec une tarification transparente à partir de 55,99€ HT/mois pour 1 utilisateur (engagement 1 an, soit 20% de réduction), Axonaut garantit des données hébergées en France et promet un gain de temps moyen de 2h/semaine. La solution est déjà immatriculée pour la facturation électronique 2026 et s’intègre à plus de 14 000 outils externes.
FreshBooks
FreshBooks représente une solution internationale de comptabilité basée au Canada, ayant atteint une valorisation de plus d’un milliard de dollars grâce à un financement total dépassant 130 millions de dollars. Destiné principalement aux PME, freelances et solopreneurs en Amérique du Nord et en Europe, ce logiciel SaaS accessible sur ordinateur et mobile affiche une note de 4,5/5 basée sur 4 492 avis et est recommandé par PCMag.com. FreshBooks se démarque par ses fonctionnalités de facturation avancées : création rapide de factures personnalisées, calcul automatique des taxes, paiements en ligne (ACH et carte de crédit), facturation automatisée et rappels de paiement permettant aux utilisateurs d’être payés deux fois plus vite. Le suivi des dépenses inclut le scan mobile de reçus, l’importation bancaire automatique et la catégorisation intelligente. La solution propose également des outils de comptabilité en partie double, des rapports financiers puissants, un accès facilité pour l’expert-comptable, ainsi que des modules de gestion du temps, de paie et de suivi kilométrique. Avec un prix d’entrée à partir de 10,80€/mois et une offre promotionnelle de 50% de réduction pendant 6 mois, FreshBooks intègre plus de 100 applications (PayPal, Mailchimp, Zapier, Gusto, Square) et dispose d’une API gratuite. Les utilisateurs rapportent économiser jusqu’à 553 heures et 7 000$ annuellement. Néanmoins, certains points d’attention incluent le coût croissant lors de l’ajout d’utilisateurs et des retours mitigés sur le support dans certains cas spécifiques.
Sage
Sage incarne la référence historique du marché comptable français avec plus de 40 ans d’expérience et la confiance de plus de 2 millions d’entreprises dans le monde. Cette entreprise propose un écosystème complet couvrant tous les segments : TPE (Sage 50, Sage Active), PME (Sage 100 Comptabilité), ETI et grands groupes (Sage FRP 1000, Sage X3), ainsi que les experts-comptables (Sage for Accountants). L’offre 2025 se distingue par l’intégration de Sage AI pour une vision dynamique et des décisions guidées par l’intelligence artificielle, ainsi qu’une conformité totale à la facturation électronique avec la Plateforme Agréée Sage incluse sans surcoût. Sage 100 Comptabilité, fleuron pour les PME, propose trois versions évolutives (Essentials dès 936€/an DSU, Standard à 1 491€/an, Premium à 2 223€/an) avec comptabilité générale, analytique et budgétaire, disponibles en mode Cloud. Les solutions cloud comme Sage Active démarrent à 12,50€/mois (offre flash avec -50% les 3 premiers mois), tandis que Sage Business Cloud Comptabilité propose une formule Start à 9€/mois et une version complète à 25€/mois. Sage garantit la conformité aux dernières normes (FEC, télédéclaration TVA, RGPD, réforme ANC 2025) et offre une assistance 24h/24, 7j/7. La force de Sage réside dans sa modularité permettant de répondre à des besoins très spécifiques, bien que son niveau d’automatisation reste moyen comparé aux solutions natives cloud plus récentes. Les entreprises bénéficient d’une transition progressive vers le modèle d’abonnement DSU avec trois niveaux d’assistance (Classic, A&T, Serenity).

